La emperatriz Isabel de Portugal muri en 1539 y su cadver fue llevado a Granada, segn deseo del emperador Carlos V. El cadver de la bellsima emperatriz fue escoltado por nobles y militares y, al llegar a la entrada de Granada el 16 de mayo de 1539, su atad fue abierto para verificar su contenido. Al ver en qu estado haban quedado los restos de la hermossima Isabel, Francisco de Borja dijo: Ya no servir ms a seor que se pueda morir. Y entr en la Compaa de Jess. El Papa Clemente XI lo canoniz en 1671 como san Francisco de Borja.